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舟山市总工会成立于1987年3月，舟山市总工会现设主席1人，副主席3人，挂职副主席1人，兼职副主席2人，经费审查委员会主任1名。舟山市总工会下设办公室（经审办）、基层工作部、经济保护部（技协办）、权益保障部、财务部（资产监管部）、市直属工会工作部5部1室及市工会女职工委员会。舟山市总工会下属五个事业单位：市财贸工会、市海员产业工会委员会、市工人文化宫（市职工业余学校）、市总工会职工维权帮扶中心、市总工会普陀山工人休养院。

舟山市总工会是本市各县（区）、功能区总工会，市产业工会，市直属部门工会的领导机关，市总工会由市委、省总工会领导，其主要职责是：

一、根据党的路线、方针、政策和中心任务及市委和上级总工会的工作部署，开展工运理论研究， 拟定舟山工运发展规划，确定新区（全市）工会工作的基本思路和工作目标任务，指导新区（全市）工会工作。

二、贯彻执行上级总工会和市工会代表大会的决议，依照法律和《中国工会章程》，组织和指导新区（全市）各级工会认真履行维护、建设、参与、教育的社会职能。

三、发挥党和政府联系职工群众桥梁和纽带作用，及时向新区党工委、管委会和市委、市政府以及上级总工会反映职工群众的意愿和要求，提出意见和建议；参与涉及职工切身利益的政策、制度的制定；参与涉及职工合法利益的重大问题调查处理；参与困难职工帮扶救助，提供服务平台。

四、依照《工会法》和《中国工会章程》，负责指导基层工会自身改革和建设；协同县（区）委、功能区和市有关产业系统、直属单位党委（党组）做好工会领导干部管理工作，负责工会干部的管理和培训。

五、受市委、市政府委托，负责组织实施市劳模、市“五一”劳动奖章（状）获得者的评选、表彰以及管理服务工作；负责全国、省劳模和模范集体以及全国、省“五一”劳动奖章（状）获得者的推荐、管理服务工作。

六、组织和代表职工参与国家、社会事务管理，指导检查督促企事业单位实行厂务公开民主管理；参与协调劳动关系，为职工提供法律援助；参与对企业安全生产保护进行检查督促；参与职工伤亡事故的调查处理。

七、参与对职工队伍思想政治教育，组织指导基层工会文化体育阵地建设，指导基层工会开展职工文化体育活动；负责工会新闻舆论媒体宣传。

八、依照《工会法》和《工会女职工委员会工作条例》，负责基层工会女职工组织建设，依法维护女职工的合法权益和特殊利益；组织开展符合女职工特点的活动。

九、负责工会经费的收缴、使用、管理以及审查、审计监督工作；负责工会资产管理、增值保值。

十、开展与境外城市工会的交流合作，发展同港澳台工会组织的友好关系。

十一、承办新区党工委、管委会和市委、市政府以及 上级总工会交办的其他事项。