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阜阳市总工会是中共阜阳市委领导下的职工自愿结合的工人阶级群众组织，阜阳市总工会是党联系职工群众的桥梁和纽带，阜阳市总工会是全市各级工会组织的领导机关。

阜阳市总工会机关设办公室、 组织工作部、劳动和经济技术部、权益保障部、网络宣教部、财务和资产管理部、经费审查委员会办公室等7个职能部室， 下辖阜阳市工人文化宫、阜阳市职工服务中心2个事业单位。阜阳市总工会辖8个县（市、区）总工会，以及阜阳经济开发区总工会、阜阳合肥现代产业园区总工会。

截至2024年底，阜阳市全市有基层工会组织8043个，涵盖法人单位8583个。建会单位职工943511人，其中，女职工365313人；工会会员912321人，其中，女会员353395人。工会专职工作人员2020 人，兼职工作人员17275 人。